Не совсем понятен вопрос. Все же, вас интересуют микроконтроллеры или платформы? Для простоты - ATmega168 - микроконтроллер. Arduino Pro Mini - платформа на его основе.
Платформы на x86 делают. Заходите в любой магазин компьютерных комплектующих и спрашиваете материнские платы формата mini-ITX. Это оно.
Про микроконтроллеры (микроконтроллер - однокристалльное устройство!) на базе x86 я не слышал.