Насчёт удаления есть нюансы:
— обычное удаление (apt-get remove) удаляет файлы приложения, но не удаляет настройки (по аналогии с windows — не чистит за собой реестр, да и program files не всегда полностью, какой-нибудь settings.dat останется), то есть установив приложение в следующий раз получите те же настройки, что и были
— полное удаление (apt-get purge) удаляет всё, и программу, и настройки
— автоматическая очистка (apt-get autoremove) — удаляет больше не нужные пакеты (те, что были вытащены по зависимостям для других, уже удаленных, пакетов и больше системой не используются)
Проверка целостности зависимостей apt-get check — может помочь в случае если при установке/удалении возникли фатальные ошибки
Менеджер пакетов Synaptic тоже как-то поддерживает эти команды
Проверить рендеринг (может драйвера не встали) можно командой «glxinfo» («glxinfo | grep render» — пропустить кучу технической инфы) — должны быть строка «direct rendering: Yes» и строка как-то связанная с видеочипом, оценить скорость по «glxgears»
P.S. Я вот в Windows не знал куда что-пишется при установке/запуске приложений, приходилось ставить проги типа Ashampoo Uninstaller и/или FileMon/RegMon, такие неожиданные места временами попадались, что у «наколенных» шаровар, что у «тру» программ от MS