разделять ресурсы на материальном уровне - два.
Очень странная фраза. Поясните.
Да и надёжность сравнительно упадёт.
Вот это вообще перл. Почитайте для чего нужен RAID.
Мой совет:
Делайте RAID, две группы дисков, одну под систему, другую под вируталки. И все у Вас будет хорошо)