В чем заключается такая большая разница? Ведь есть, стало быть ,какие-нибудь различия, иначе зачем платить больше?
Тут все зависит от ценовой политики конкретного регистратора или его партнера и его принципов работы с клиентами (условия предоставления услуг).
Часто регистраторы дают хорошие партнерские скидки, по партнерской программе, поэтому купить домен "по розничной цене" может быть дешевле не напрямую у регистратора, а у одного из его партнеров. Со списком аккредитованных регистраторов в доменах .ru можете ознакомится тут:
www.cctld.ru/ru/registrators/
Для клиентов, при выборе между регистраторами, обычно играет роль репутация компании(надежность), простота оформления или переноса домена, стоимость не только регистрации, но и продления. Бывает что регистрация предлагается по одной цене, а продление уже по более высокой, и цену продления могут не указывать на странице регистрации. Бывает что домен проблематично перенести к другому регистратору или могут в любой момент потребовать сканы документов подтверждающих личность.