Проверьте файлы init.php and dbcon.php в папке /bitrix/phpinterface.
Удалите из этих скриптов закрывающий тег ?>
То есть закрывающего тега ПХП ?> в конце файла не должно быть!
Проверьте в файле init.php выводятся ли какие нибудь HTML теги.
Пример:
function showPopup(){?>
<div class="popup"></div>
<?}?>
Попытайтесь перенести временно все такие скрипты в header.php или закомментировать в инит.
Проверьте заработало ли авторизация.