Надо посмотреть пути для сессий. По умолчанию как то так
php_admin_value session.save_path /tmp/php_sessions/ext_www/automanarch
php_admin_value upload_tmp_dir /tmp/php_upload/ext_www/automanarch
Если этих папок не существует или к ним нет доступа то будет наблюдаться такая проблема.