Если вы про стандартный автоброкер от Яндекса, то если кратко - это система защиты от переплаты за клик, например если вы поставили ставку в 3 у.е и стратегию Показ в спецразмещении по минимальной цене, а на самом деле стоимость попадания в СР стоит 1 у.е. то Яндекс не будет тратить ваши 3 у.е. при клике он будет использовать минимальную необходимую ставку - 1 у.е.
Есть еще внешние системы, так называемые бид-менеджеры, они работают с Директом по АПИ и тоже корректируют ставки для достижения определенных целей: снижения стоимости клика, удержания объявления на определенных позициях и тд.