Все posix-совместимые файловые системы такое допускают. То есть практически 99% файловых систем на *nix
в Windows этого не допускает ни одна родная система (ни FAT ни NTFS)
NTFS позволяет, но Windows не будет нормально работать с такими файлами. Если создать под линуксом и записать туда разное содержимое, но Windows при открытии обоих будет открывать всё равно только один из них (хотя в папке отображаться будут оба).