Вы случаем не с фронтальной стороны системного блока подключаетесь? если да, то провод от панели проходит мимо жестких дисков наверняка, как раз они и могут быть причиной шуршания, когда диск активно работает. у меня такая фигня тоже. подключаю все в заднюю панель.