Выбор шаблона происходит в файле template-loader.php, он подключается напрямую из wp-blog-header.php (который в свою очередь подключается из index.php) после разбора основного запроса.
Ну как пример — функции the_content и get_content . Применяются как в отдельных шаблонов типов записей (page.php, post.php и т.п.), так и в шаблонах архивов (archive.php и т.п.) в зависимости от шаблонов.