Если вопрос в надежности, то выбирать нужно (мы же о зонах рунета говорим, так?) аккредитованного регистратора. Только они имеют официальное права записи в реестр. Остальные не более чем ресселеры и при работе с ними возможны нюансы (ресселер может зарегать домен на себя). Список официальных регистраторов:
www.cctld.ru/ru/registrators/
Из все списка лучше регать в nic.ru или reg.ru. Я рекомендую reg.ru потому что: 1) у них есть программный API которые позволяет управлять доменом; 2) бесплатно предоставляют DNS сервер. Ну и в целом более клиенто-ориентированные.