Кто к чему привык, желательно с хорошо знакомой системой работать. У каждой свои нюансы - у центоса лучше и разнообразнее поддержка железа, убунта самая простая из вышеперечисленных в настройке, да и мануалов полно, в дебиане стабильные пакеты. FreeBSD - это не linux^ там своего геморроя достаточно, новичкам бы не советовал. Или наоборот, как я, начать с freebsd, окунуться в ад, потом линукс гораздо проще изучать ;) Freebsd хорошая система, но для нее нужно достаточно свободного времени, ИМХО.
UPD:У самого хостинг на дебиане в наследство достался, проблем пока не обнаружено)