Безопасно, пока аккумулятор живой. Если аккумулятор выйдет из строя (разрыв электрической цепи внутри батареи), на этом потребителе может быть напряжение всех трех оставшихся банок.
Ну и вопрос (раз)балансировки всей батареи при штатной эксплуатации - но при совсем малом токе потребления микроконтроллером им можно пренебречь.
P.S. Может, лучше от всей 48В батареи через что-то подобное запитать?
https://www.chipdip.ru/catalog/ic-dc-dc-converters...