Заинтересовал ваш вопрос, реализовать у меня получилось...
Насколько мне известно два конфига у клиента одновременно включить невозможно, по крайней мере на android именно так...
Тогда необходимо два конфига, грубо говоря, объединить в один и развести необходимые вам подключения по пирам, но для этого необходимо вносить правки в один из серверов wireguard...