1. Как правильно склеить домены?
301 редирект - это основной инструмент. Еще, в Гугл Серч консоли войдите в Настройки - Изменение адреса - Выберите новый сайт. Это даст дополнительный сигнал Гугл.
2. Если через год домен site-moscow.ru кто-то другой зарегистрирует и восстановит его из вебархива, не вернется ли вес сайта к этому домену?
Может и такое быть. Вернуться вес старого сайта. Поэтому лучше не теряйте этот домен если над ним была проведена определенная работа.