Вот пример расчета оверхеда при использовании IPv4 поверх GRE поверх IPSec (поверх IPv4). Насколько эти 56-76 байт "значительны", трудно судить, не зная критериев оценки "значительности".
Как вариант собрать статистику до шифрования и после, например командой: # iptraf -z eth0
Возможно другим подходящим инструментом или проанализировать результат tcpdump'а.