Включите
локальный smtp и позвольте пользователям подключать любые ящики.
Вы можете упростить подключение яндекс почты, если подключите его как приложение согласно
статье в документации (см. Коробочная версия Битрикс24).
Это рекомендуемый способ как этого достичь.
Еще можно купить приложения по подмене smtp аккаунта отправителя, например "Вебпростор: Отправка почты через SMTP", "Fusion: Прозрачная почта" и другие. Однако это менее рекомендумый вариант.
Просто на сколько я понимаю, если указать несколько аккаунтов в конфиге msmtprc , то это не заработает а будет браться первый конфиг сверху.
Будет браться либо дефолтный, либо заданный явно.
Например можно сделать custom_mail и на основании входящих параметров поискать подходящий account и подставлять его для отправки - тоже вариант.