Форм-факторы для этого и нужны, чтобы гарантировать поддержку плат.
Если и производитель материнской платы, и производитель корпуса заявляют о micro-ATX - 99%, что проблем не будет, все поместится.
Но стоит учесть и замечание
alexalexes , плата залезит, а остальное не факт.
Если размер корпуса не имеет значения - советую заменить на поддерживающий ATX, таких плат и больше, и лучше, и часто корпусы поддерживают установку более мелких плат.