Обычно на материнках такого класса встроен псевдорейд, то-есть обычная пометка диска как рейда, но ни отдельного контроллера ни особой логики там нет, сложно сказать как он себя поведет, я бы поступил так: снял полный дамп системы например с помощью
clonezilla поставил новые диски, собрал рейд и потом развернул на него образ, так меньше всего шансов потерять данные да и быстрее всего, можно попробовать и вашим вариантом, теоретически может сработать.