Это сильно зависит от целевой потребности, от архитектуры используемого Битрикс24, от навыков системного администратора. Надо сказать что 500ГБ это не большой портал.
Если предположить что у вас один сервер, на котором находится и файлы и базы данных и сама система то мы обычно поступаем так:
1. Бекап базы данных снимать через Percona XtraBackup.
Можно использовать mysqldump с разными опциями производительности, но тут уже зависит от разных обстоятельств.
2. Файловая часть.
Тут зависит от способа ведения разработки и других требований.
В самом простом случае: просто tar'ом в архив и отправка на сервер бекапов
Если места не очень много: rsync на удаленный сервер as is
Если есть разработка то снимается 2 бекапа: ядро (все кроме папки upload) и файлы (только upload).
Методы те же.
Т.е. по факту разработчикам отдается дамп базы и ядро, а пользовательские файлы не передаются.
Если есть git с внешним репозиторием, то можно снимать вообще 2 бекапа: ядро (только папка bitrix) и файлы (только папка upload)
Иногда используется сокращенный бекап: средствами системы формируется бекап без поискового индекса и папки upload и хранится он в облаке б24, а файлы в файловом хранилище (AWS S3-совместимое хранилище, например Yandex.Object Storage).
Все очень индивидуально.
Средний