Да, будет работать на скорости PCI Express 3.0 x4. Если нужно, перечитайте мануал ещё раз, там сказано, что этот слот поддерживает в т.ч. и M2 SATA SSD. Но вы купите NVME.
На мой взгляд, важно обратить внимание на то, что "
M2 socket shares bandwidth with SATA ports":
Т.е. пропускная полоса шарится между М2 и САТА 5/6, соответственно, последние станут недоступны.
Второй M2-разъём (работающий на PCIe 2.0), похоже, расшарен ещё сильнее.