Виталий, у certbot'a есть плагин для DNS-верификации, но естественно он требует прав на добавление записей в домен. А если вам ехать надо, пишите ППР в трекер и ручками-ручками обновляйтесь. (Вроде как мне попадался режим certbot renew в котором DNS TEXT-запись выдавалась на экран, после чего её надо было запихать в DNS-зону вручную и нажать enter)