Что это может быть
С определённой вероятностью флешке кирдык :(
Проверьте также какова ситуация с остальными файлами.
Если какие-то файлы выглядят лучше, то попробуйте их открыть после копирования на жёсткий диск, также можете пару раз корректно вынуть/вставить флешку, оба раза копируя файлы, а потом сравнить их содержимое в хекс-редакторе.
Если различается, то нехорошо. Хотя не все контроллеры будут отдавать различающиеся данные.
Кстати, раз умеете пользоваться хекс-редактором, то можно и образы накопителя посравнивать.
Также попробуйте пройтись по флешке программой для восстановления данных, которая сама должна находиться на другом диске. Я традиционно предлагаю бесплатный R.saver:
https://rlab.ru/tools/rsaver.html
Вдруг получится восстановить предыдущие ревизии файла или что-то подобное.
возможно ли получить изначальные данные файла?
Скорее да, чем нет, но только не в домашних условиях.
С высокой вероятностью вам потребуется обратиться к специалисту, который умеет работать с памятью напрямую, минуя контроллер.
Если вы в Москве - будем рады помочь, если нет - вот универсальная статья о
выборе фирмы по восстановлению данных.