Версия 3.2 и ниже: WooCommerce > Settings > Products > Display > Product Images.
Версия 3.3 и выше: Настроить (Customizer) - WooCommerce > Product Images
Задаете нужную обрезку или произвольные размеры.
Сохраняете. Потом при необходимости , если ничего не изменилось сразу, ставите плагин Regenerate Thumbnails и регенерируете миниатюры. (там в один клик все делается).