zooks

Делал респонсив таблицы как раз по этому примеру - пришлось переписать скрипт, чтобы он покрывал все таблицы.
Если хочется чего-то попроще, то можно просто сделать горизонтальную прокрутку при переполнении.

В чем проблема прописать стили самостоятельно? Форма тривиальная.

Сайта нет, похоже на самопис на PHP.

Жмите F12 и смотрите консоль.

Препроцессоры и сборщики - это кому как удобнее. Хочешь руками лопатить - вперед.
Забыли про валидацию кода (в разумных пределах).

Отказывайтесь от технологии Flash.
Запустить внутри flash нельзя, но можно сверху ролика наложить iframe.

Знаю только Billmanager от ISPsystem.

Это происходит из-за margin в .header--logo

Конечно не стоит пихать в одну статью инструкцию по инсталляции Windows 3.1 и Windows 10.
Но если это схожие системы, например, Windows 8.1 и Windows 10, то почему бы и нет.

Если у вас Apache, то настройте .htaccess - в корне сайта валяется заготовка.

Начал верстать на bootstrap

Он нужен для макетирования, не для нормальной верстки.

Mobile First у вас в принципе нет. Почитайте про наследование в CSS.

повесил fail2ban на mysqld

Нужно закрыть внешний доступ к MySQL:
sudo mysql_secure_installation

для каждого сайта создал своего пользователя mysql

Нужен не только отдельный MySQL пользователь, но и пользователь на уровне ОС - это даже важнее.

Когда вижу портянку кода, рука тянется к кнопке Пожаловаться.
Смотрите в чанках что не так.

Выставляйте display: none, font-size: 0px - это какое-то читерство в SEO.

Нужно обновить плагин на gulp-refresh.

Чтобы поправить конфиги подойдет nano или vim.
А вообще скачивайте весь проект на локальный компьютер и работайте с кодом, как это делают все.