Похожая ситуация, работаю над проектом, программа считает активность и сохраняет скрины с монитора + экрана от ноута. С учетом того, что приличный кусок времени нужен, чтобы подумать над решением задачи, сделать наброски на бумаге, подготовить прототип на бумаге и иногда поискать решение на подобных проектах, апворк со своим тайм чекером очень не радует.
Но я подошла к этому философски :) Все мысли записываю в блокнот, и разжевую проблему там же в блокноте, скетчи делаю от руки в фотошопе или иллюстраторе, и переписку по проекту тоже пишу со включенным таймером.