Если к серверу есть доступ через SSH (а у большинства хостеров он есть), то не нужны никакие посредники.
Ставите гит и он прекрасно живёт внутри домашней папки даже.
То есть рутовые права не нужны чтобы гит поставить.
Ну а репозиторий гита - это тоже просто папка.
В принципе, наверное можно поискать и возможно есть способы организовать доступ к репозиторию и через фтп.
Кстати, как вариант, вы можете примапить ФТП как сетевой диск к локальной машине.
Тогда на удаленной машине даже гит ставить не надо, все можно делать на локальной машине.
Во всяком случае, в линуксе это делается без проблем.

Такая же фигня свалилась )

Непонятно зачем сам прокси должен быть на джаве.
Бери вообще любой.
Но раз вопрос был задан, я поискал и нарыл вот такой (jsocks.sourceforge.net/).
Сам не использовал, не знаю что это такое, но прокси-классы внутри есть.
И раз исходники открытые, то и какой угодно логгинг и капчуринг прикрутить не сложно.