Команда mongod не работает?

Отлично - поменяйте

dbPath: /usr/local/var/mongodb

и попробуйте перезагрузиться . (я правильно понял, что это из старого конфига?)

Команда mongod не работает?

Посмотрите на mongo.conf, может каким-то образом он поменялся на дефолтный?
Вы помните, где у вас лежала база данных?

Почему результат исполнения команды из терминала и из python отличается?

Ярослав Белаш, не знаю...

Почему результат исполнения команды из терминала и из python отличается?

Ярослав Белаш,
Можно попробовать запустить так

sudo -u u2 TERM=xterm-256color tmux ls

Почему сервер на Docker иногда даёт 504 ошибку?

очередь реализовать с лоадбалансером? Хотя бы в какую сторону думать. Разве это не должен лоадбалансер с nginx по дефолту делать?

Лоадбалансер умеет распределять запросы по бэкенд серверам.
Если есть бэкенд сервер, способный обработать 10 запросов в секунду, то поставив 10 серверов и лоадбалансер, мы сможем обработать 100 в секунду (в теории).
Что делать если запросы поступают пачками - 6000 запросов раз в минуту? Как раз в этой ситуации поможет очередь (RabbitMQ, например) - туда будут складываться запросы, а потом кто-то будет брать запросы из очереди и направлять в лоадбалансер. Если у вас такая ситуация с поступлением запросов, очередь может помочь.

Почему сервер на Docker иногда даёт 504 ошибку?

если пытаюсь занимать порты 8090 и дальше, ломаются прошлые контейнеры. Больше 9ти не выходит, вообщем. от 8081 до 8089,

Странно...
Попробуйте начать от 80000, например.

Почему результат исполнения команды из терминала и из python отличается?

Ярослав Белаш,
запустите тогда команду

env

двумя способами, так мы сможет сравнить их

Почему сервер на Docker иногда даёт 504 ошибку?

kkolorid, поскольку этот контейнер для нас "черный ящик", то единственный способ - проверить.
Если не поможет, надо подключить очередь или другой механизм для "уплощения" запросов в единицу времени.

Почему результат исполнения команды из терминала и из python отличается?

Ярослав Белаш, тьфу, это я запутался, вы правы.

Добавьте '-i':

sudo -i -u u2 tmux ls

Почему сервер на Docker иногда даёт 504 ошибку?

kkolorid,
вам нужно что-то вроде

docker run -p 8080:8080 project
docker run -p 8081:8080 project
docker run -p 8082:8080 project
.....

Почему сервер на Docker иногда даёт 504 ошибку?

kkolorid,

Дело в самом контейнере, мне кажется

Поэтому я и предлагаю поднять несколько контейнеров параллельно.

Почему сервер на Docker иногда даёт 504 ошибку?

могу ли я в самой программе на питоне запускать docker сервер

разумеется можно, например через os.system().
Но опять-таки я не уверен, что понял для чего.

Если мы не знаем, как сделать контейнер с аппликацией более производительным, я бы вернулся к идее поднять несколько контейнеров с лоадбалансером перед ними. Вот пример https://levelup.gitconnected.com/set-up-a-nginx-lo...

Почему сервер на Docker иногда даёт 504 ошибку?

kkolorid, может я чего-то не понимаю, но не вижу как это может помочь

Указал частный прокси, но 2ip всё равно видит мой айпишник?

Не надо, просто добавьте в .bash_profile

Указал частный прокси, но 2ip всё равно видит мой айпишник?

да, и НЕ перегружать

Почему сервер на Docker иногда даёт 504 ошибку?

kkolorid,
К сожалению, навскидку я не могу понять, как у них можно увеличить количество параллельных workers/threads для обработки запросов.
Так что единственное что могу посоветовать - это спросить у разработчиков, и это похоже вы уже сделали https://github.com/rahiel/open_nsfw--/issues/3

Какие посоветуете настройки в /etc/my.cnf для Centos с 512 мегами памяти без swap?

pcdesign,

еще лет 10 назад - машина с 512 мегами была вполне достойной.

- для разработки - да. Серверы уже тогда были как минимум с 4ГБ.
Производительность зависит, ес-но, от размеров базы, плагинов и т.д., но 512МБ для "настоящего" сайта мало.
Насчет оптимизации запросов - во-первых, можно найти и отключить наиболее "тяжелые" плагины. Во-вторых, можно патчить код. В третьих, можно добавлять/менять индексы.

Почему сервер на Docker иногда даёт 504 ошибку?

kkolorid, на чем написан сервис под докером?

Почему сервер на Docker иногда даёт 504 ошибку?

как поднимать несколько контейнеров сразу?

поднять несложно - можно например на разных портах.
Но чтобы было удобно пользоваться, надо поставить перед ними лоадбалансер - не суперсложно, но надо будет изучить как.

Почему сервер на Docker иногда даёт 504 ошибку?

docker logs container

можно с "-f" для просмотра в реальном времени.
Что искать - ошибки аппликации, которые должны помочь понять в чем проблема при большой нагрузке.