Мониторю контейнер командой "htop", нагрузка в нем 0.1-4% от оперативки и так на протяжении всей его работы
Что-то мне не верится. У вас cronjob для мониторинга или время от времени запускаете вручную?
Я бы сделал cron типа
top -b -o +%MEM | head -n 10 >> /tmp/memory.out
Уверен что мы увидим memory leak.
Насчет идею отключить OOKiller - я не знаю, что точно будет происходить, но уверен, что это не улучшит ситуацию.