Например в том, что у вас отключены подробные сообщения POST и при этом включена "медленная" процедура POST по полной программе. В итоге машина стартует сразу же, но увидите вы что-то только после прохождения полной процедуры POST, что может занять несколько секунд. Второй возможный вариант - включение Network Boot что может еще больше времени занимать.