Ну реализуйте в ардуйне протокол работы по COM-порту, который будет в епром писать полученные данные. И софтину, которая будет на ПК реализовывать этот же протокол.
Если это Turbo Pascal есть шансы, что в иде есть соответствующие сигнатуры для FLIRT. Не работает отладка в виртуалке - отлаживайте на реальном железе.
Поиск по процессам perl.exe (или как там у него называется exe), получение параметров командной строки для этого процесса, поиск в ней нужного имени скрипта. Как-то так. Или доработка скрипта, чтобы он создавал lock-файл.
Запись куда? В RAM (и какого типа?) или во Flash? А есть еще SPI, I2C и прочие микросхемы с ячейками. Можете взять даташит на любую Flash-ROM микросхему и там посмотреть, обычно это там раписано.
Конечно стоит, если ничем более полезным вы заниматься не можете. Попутно пополните словарный запас и, возможно, закончите как директор центра американского английского.
Вполне вероятно что у новой матрицы несколько иной протокол обмена с матерью. Или другой алгоритм работы и по умолчанию яркость 100%. Или еще что-то не так. Проблемы с подсветкой при замене матриц (даже на аналогичную) бывают.