Manul уже неактуален, к сожалению, Яндекс прекратил поддержку. Айболит поможет вылечить сам код, но может не найти дыру в сайте, через которую тебя заразили редиректом.
sql-инъекции можешь найти с помощью detectify.com/metascan.ru/sqlmap, затем нужно их устранить в самом коде, иначе хакеры опять тебе внедрят :)