1. Смотря на каких операциях.
Операции бывают ОЧЕНЬ разные.

2. Смотря какой софт.
Если у вас есть софт, способный распараллеливаться и выполняться на GPU - у GPU больше операций будет на несколько порядков, да.
А, скажем, если вы каждый перебор пароля проверяете методом отправки на сервер в интернете - разницы нет.

Давайте я вас сведу вместе
Как участвовать в IT сфере школьнику?
Выбор игрового движка для текстового квеста?

Программер ищет прктики.
Автор игры ищет программера.

ln -s мне представляется более правильным решением.
по крайней мере штатно инсталляторы пакетов делают именно так.

чтобы уметь настраивать окружение, устанавливать мои приложения на сервере

Ставить серверную ОС.
В виртуалке.
Как правило это Linux, FreeBSD, Solaris.
Но не MacOSX. К примеру, там другой автостарт. И куча т.п. мелочей

А общего у MacOSX и Linux только Posix, world utilities и shell.
Но это уже прекрасно поддерживается и в Windows 10 (Ubuntu Linux Subsystem on Windows) без виртуальных машин.