Ну, тут просто google любит eclipse, для того же андроида есть куча плагинов именно к эклипсу и даже официальная сборка этой IDE по типу скачал-распаковал-начал быдлокодить.
1. Значит так, забудьте про Битрикс. Кривая, глючная, дорогая и неработающая CMS. Главное преимущество — большие откаты для партнерских студий. Лейбл 1С в ней совершенно сбоку, от самой 1С там только доля в бизнесе. Ни людей, ни идей, ни интеграции там нет, это совершенно отдельная разработка. Вообще «недостатки битрикса» в яндекс и внимательно читать тех, кто реально с ней работал.
2. Без ТЗ говорить сложно, но если основная проблема это количество наименований номенклатуры, то смотреть в сторону ShopCMS. 200 000 не видел, но я делал достаточно посещаемый сайт на 40 000 наименований. Держит вообще без вопросов, поиски — отборы, все это почти без доработок и живет на обычном shared хостинге. Битрикс с такими объемами и на отдельном сервере не заведется. Не реклама, урл магазина могу дать в личку.
3. Из того, с чем я работал, могу точно сказать, что osCommerce, Webassyst и Joomla+VirtueMart не заведутся, Amiro скорее всего не заведется. Или придется искать рашпиль и к нему виртуоза-комсомольца. Netcat возможно заведется, но гарантий не дам.
Я просто не спец по конфигурациям 1С, под «малым предприятием» я имел в виду «упрощенку». Честно говоря не знаю, чем она принципиально отличается от «предпринимателя», возможно в последнем нельзя иметь сотрудников (так как пишут про совместимость с «зарплатой»).
Вообще, чем хорош 1С по сравнению с веб-сервисами — это а) интеграцией с банк-клиентом и б) «обыскоустойчивостью» (возможностью хранения вашей реальной информации в зашифрованном архиве где-нибудь в облаке дропбокса).