Тут был ответ от одного пользователя. Его ответ мне помог, зашел проголосовать, но почему-то ответ пропал. Напишу по памяти ответ и свои мысли.
1) Чтобы скорость была выше, пробовать использовать флешки более высокой скорости. В моем случае это не подходит, так как из windows записывается быстрее.
2) Ubuntu плохо опеределяет окончание записи файла, поэтому нужно ориентироваться на мигание лампочки флешки. Грубо говоря, после того как запись файла будет 100%, нужно подождать около 5 минут (если нет лампочки на флешке). Этот совет мне помог.
3) (от себя) После записи на флешку проверяю контрольную сумму файла на жестком диске и флешке. Вроде это работает.
В общем, после того, как я стал выжидать время после записи на флешку, а также закрепляю результат проверкой контрольной суммы, фильмы и мультики начали нормально открываться и воспроизводиться на телевизоре с флешки.