Анатолий

Вы вкурсе что такое дебаг? банальных эхо каждой итерации цикла вам покажет в чем проблема. начните с того чтоб проверить точно ли селектор работает правильно на первой и второй странице

Да, любой запрос на форму логина с последующим созранением куки вам поможет, авторизация находится в куках, если будете их использовать то сайт вас запомнит

Никак не сделать, нужно отдельно обрабатывать хеш руками для ваших нужд.

Смысл модели как раз в самодостаточности, она не знает кто ее использует, где кто хранит данные, она получает порцию, работает с ней и отдает обработанные данные, как черный ящик. Это идеальная модель. Поэтому вы пытаетест сделать анти модель, которая зависит как минимум от библиотеки Registry. А зависимость не всегда хорошее решение. Хрен его знает кто где перезапишет ваш ключ в этой библиотеке. Банально в другом месте вы забудете что такой ключ уже есть и используется.

Чисто теоретически плюсов нет, жс сам по себе не на столько быстрей чем пхп (а быстрей ли?) чтоб его в пхп совать как расширение. Пхп интерпретируем, поэтому как встроенный язык жс тоже не катит. Единственный плюс который я вижу - поддержка asm.js. Я больше не могу ни одного преимущества придумать.
Если есть куча кода на жс, то лучше уж ноду поднять, чем такими вещами извращаться.

$mess = ' '.$get['mess'];

Думаю из-за этого, судя по всему переменные вы один раз в начале заполняете и дальше просто выводите со старыми переменными хтмл

<? 
$get1 = mysql_query("SELECT * FROM notifications WHERE toag='".$_SESSION['agent_id']."' ORDER BY id DESC limit 100");
     while($get = mysql_fetch_array($get1)){
if($get['author'] == '0'){
    $author = 'Администрация';
}elseif($get['author'] == '1' or $get['author'] == '2' or $get['author'] == '3'){
    $author = 'Разработчик';
}else{
    $author = 'Спецагент #'.$get['author'];
}
$mess = ' '.$get['mess'];
$notifi = '<div class="notice_request_list" style="display: "><div id="notice_request_row_10000" class="notice_request_row">
  <div class="notice_request_info_wrap clear_fix">
    <a class="notice_image_link fl_l" href=""><img class="notice_request_img" src="/img/admin_avatar.png"></a>
    
    <div class="notice_request_info fl_l"> 
<a class="mem_link">'.$author.':</a>'.$mess.'<div class="notice_request_buttons clear_fix">
        <a class="fl_l" href="#"><button class="flat_button button_small">Прочитал</button></a>  </div>
    </div> </div>
  </div>
</div>';
     echo $notifi;
     }

      
     ?>

Вы установили фреймверк, и затем еще раз устанавливаете фреймверк? библиотека и есть фреймверк.