В php части формируете необходимый url:
$id = your_counter_id;
$token = your_oauth_token;
$url = 'http://api-metrika.yandex.ru/stat/traffic/summary.json?id=' . $id . '&oauth_token=' . $token;
$url .= '&date1=' . date('Ymd', strtotime('-1 month')) . '$date2=' . date('Ymd');
// Делаете запрос и получаете json
$json = file_get_contents($url) // Либо через curl
Теперь у Вас есть
json. Передаете его в js и там уже заполняйте из него данные для плагина графика. Конкретно, Вам нужен элемент data, а точнее:
data.visits = Визиты
data.page_views = Просмотры
data.visitors = Посетители.
В документации по api хорошо описано, что означает каждый элемент.