svetlov

Ваши обработчики короткие, очевидно.
В Питоне сигналы срабатывают асинхронно с небольшой задержкой.
Думаю, worker успевает закончить свое грязное дело перед тем, как управление перейдет к обработчику сигнала.

MTS подобными мелочами не заморачивается. За бугром телефом переводился сам (насколько я помню, с сообщением от оператора).

Что-то мне кажется, что без __syncthreads() дела не будет.

Ну смотрите.
Там нет массивов.
Создаете окошко — это обязательно.
Инииализируете конвейер.
Создаете vertex buffer object с координатами вершин. Да, я знаю что вершин у вас нет — но иначе шейдер не запустить, он будет работать по разу на вершину. Вершины могут быть фейковые.
Создаете текстуры. Современные видеокарты поддерживают текстуры из float — проблем быть не должно. Но следует убедиться для той видюхи, на которой все запускается — иначе нужно использовать другой способ расчета.
Устанавливаем все это добро как render state. Запускаем созданный и скомпилированный шейдер.
Он берет значения из текстур и рисует нам картинку. Вернее, шейдеров нужно два: вершинный и пиксельный. Второй должен записать результат. Есть еще выкрутасы с записью промежуточных результатов из шейдера — но тут нужно смотреть, что умеет конкретная видюха.
Берем результат. Откуда — вопрос. Если поддерживаются pixel buffer object и render target — то из PBO. Иначе из буфера экрана (надеюсь, до этого дело не дойдет, видюха будет более или менее сносной).
Может, я еще что-то забыл.

Перечисленная схема — лишь краткое изложение. На самом деле кода получается — мама не горюй. На «простое перемножение массивов» это ни разу не похоже.

Как отметить — не знаю. Кажется, это вообще невозможно.
Но в настройках Settings/Preferences/Scroll Tracking можно указать, чтобы запись автоматически не становилась «прочитанной» при прокрутке. Действует, конечно, на весь Reader а не только на выбранную подписку.

Кажется, во втором варианте второй цикл не параллелится. Замените input[j] на локальную переменную, чтобы она в регистр упала. Еще может потребоваться промежуточный массив для складывания этих input[j] — чтобы потом одним махом переключить на него после выхода за цикл.