< кэп мод >
Теория без практики вам ничего не даст. Практика без теории в конце концов приведёт к непониманию многих процессов. Ищите золотую середину.
< / кэп мод >
Если речь идёт про GNU/Linux'ы, то скачиваете какой-нибудь дистрибутив поконсервативнее ( Debian ;), ставите его желательно на реальную машину и начинаете мучать (поставить голую консоль, поднять вебсервер, понастраивать бэкапы, помучать консоль, узнать, что для выхода из vi совершенно необязательно перезагружать машину (: и т.д. ). Эви Немет вам поможет ;)
Когда немножко поднатаскаетесь, освоитесь, можно поднимать всякие виртуализации, зоопарки, ставить puppet'ы и писать рецепты под них.
Дальше можно почитать всякие умные книжки про то, как работает ядро, откуда всякие ноги растут.
Если речь идёт про проприетарные системы (чпукс, эйайикс, etc), то изучить основы на GNU/Linux'ах и топать устраиваться на работу во всякие интеграторы. Они там обучают.
И да, не надо делать упор на всякие графические утилиты. Учите консоль. В ней вся сила.
По-моему, сегодня я где-то видел статейку, про путь nix администратора. Специально для вас написали (: