Советую выпрямлять руки, выпаивать микросхему и программировать ее одну на программаторе. Применение сплава Розе сильно облегчает выпаивание.
Если объяснить происходящее коротко, то когда вы прищепкой пытаетесь программировать микросхему flash-памяти, то заодно программатор пытается запитать еще некоторое количество других микросхем, которые питаются от этой же шины питания, например мультиконтроллер, какие-то блоки хаба, еще кто-нибудь. Программатор на подобное не только не рассчитан, но и часто несет в себе защиту от повышенного потребления программируемой микросхемы. Плюс все те микросхемы, которые мы ненароком запитали, начинают жить своей жизнью и включившийся мультиконтроллер может начать вычитывать из флэшки свою прошивку, а программатор ее пытается программировать.