Достаточно открыть ssh доступ (можно сменить порт с дефолтного 22 на что то другое, меньше будут беспокоить сканеры ботов), все остальное (большая часть инструментов) будут работать через него.
scp - штатный от ssh, возможности как у обычного cp, не возобновляет прерванное копирование
rsync - умеет работать через ssh, ключ --partial автоматически дозагрузит прерванное копирование, простой скрипт будет перезапускать процесс копирования пока он не завешится корректно
while ! rsync -avz --partial --progress --inplace --append-verify --rsh=ssh /путь/к/локальному/файлу пользователь@удаленный_хост:/путь/к/удаленному/файлу; do
echo "Переподключение через 10 секунд..."
sleep 10
done
