Сергей Толкачев

С джумлой всё нормально, на четвёрке делаю магазины. С ней, точно так же как и с любым другим инструментом нужно включать голову и делать по уму. Под капотом php фреймворк с полноценным MVC, в четвёрке есть REST API.
По сути, главное что нужно - прямые руки и документирование всего того, что делается. Так как правильно написали, что любой магазин становится самописом как только начинает продавать. С джумлой самопис делать удобнее.
И важно понимать (хотя это к любому бесплатному движку относится), что джумла - не система, для которой можно накупить варезных модулей и плагинов по 300 рублей и сляпать магазинчик. Делать хорошо - в любом случае дорого. Если есть вопросы - спросите у сообщества, которое есть у любого движка. Знающие люди подскажут как стратегически, так и практически. Приходите в чат джумлы в телеграме.

В комментарии правильно спросили: для каких целей? Джумла - инструмент, которым нужно уметь владеть. Под капотом у неё полноценный PHP фреймворк, хоть и немного устаревший, со стандартами PSR. Если Вы не разработчик, а делаете сайты-магазины на потоке, то с вп, наверное, будет быстрее на старте. Но чтоб добиться нужного качества потом потребуется больше усилий. Чистый вп с чистым вукоммерсом занимает около 180 мб кода. Это их просто поставили и всё. Чистая джумла с тем же джумшоппингом занимает около 35 мб кода. Где в итоге проще будет допиливать, как Вы думаете? Да и вордпрессе нет MVC структуры, поэтому ему под капот часто подключают лару или симфони. Тогда зачем вп нужен? В джумле таких проблем нет. Сам вопрос должен звучать немного по-другому: "что лучше и удобнее поддерживать и развивать в долгосрочной перспективе? " На джумле собирают всё: как сайты на коленке, так и магазины с более чем 32М товаров (автозапчасти и т. д.), новостники с >250к уников в сутки.

Нужно на самом деле посмотреть в будущее, каким этот магазин станет со временем, куда будет развиваться, какой инструментарий потребуется. В плане Joomla + JoomShopping - все работает. Интеграции и эквайринги есть. Есть расширения для массовой обработки meta -тегов по формуле, двухсторонняя интеграция с Битрикс24.

Чисто теоретически можно добавить все файлы джумлы. Ничего особо страшного не будет. Огромная обычно папка с картинками. В гитигнор помещают её, всякие логи/кэши, awstats и т.д. Просто при обновлении Joomla вам придется её пушить в репозиторий и синхронизировать с локальной веткой.
А так выше правильно написали: ядро не трожь. Свои лейауты могут быть в папке с модулями и плагинами ну и естественно в шаблонах.

На Joomla мультирегиональность"папками" можно сделать просто с помощью меню и модулей. Решение для поддоменов тоже существует. У Joomla порог вхождения выше, она больше для разработчиков, чем ВордПресс. Каталог можно собрать просто даже на материалах. Гайд по созданию. Слишком общО спрашиваете, так как каждая CMS под свои задачи. Joomla больше фрейм со стандартами PSR.