Java EE - это зонтичный стандарт, объединяющий в себе множество других стандартов. Каждый из которых не прост и требует от программиста наличия некоторого профессионального уровня. Поэтому книг "для начинающих" о Java EE нет, предполагается, что в EE суются уже не начинающие. Можете попробовать
Энтони Гонсалвес - Изучаем Java EE 7. Она неплоха и даст вам обзор технологий по которым нужно будет искать отдельные книги.