Проджет менеджер Яндекса
ответила в
группе по Аналитике на Facebook:
"В картах Я.Метрики клики привязываются к DOM-элементам на странице, а не ко всей странице. Если какая-нибудь кнопка на другом разрешении оказалась в другом месте, то и клик сдвинется вслед за ней.
Если изменились размеры элемента, то клик отмасштабируется пропорционально изменениям."