Saboteur

Это просто исторически сложилось, и связано не столько с операционной системой, сколько с файловой системой.

В FAT16 расширение хранилось отдельно от имени, а операционная система распознавала расширение исполняемых файлов, чтобы запускать их.
В Windows пошли дальше - добавили ассоции для других файлов, к которым привязали запуск софта, ассоциации хранились в реестре и соответсвенно что запускать определялось системой, вне зависимости от вызывающей программы.
В современной NTFS расширение это уже тоже просто часть имени.

В Линукс изначально файловая система не хранила расширения отдельно, а запуск программы разбирался по заголовку файла. Вдобавок графический интерфейс появился гораздо позже, и запуск документов и других не-исполняемых программ по ассоциации делали именно в графическом интерфейсе, а не на уровне системы - сама система работает только с исполняемыми файлами, для чего есть аттрибут execute.

Вот собственно и все - то есть исторически возникло от организации файлов и файловой системы.
Оба подхода по-своему удобны.

Все зависит от хитрости пользователя.
Варианты - реестр, использования ntfs-потоков.
Но привязка к железу - не очень хорошая идея, разве что вы с софтом свой хардварный ключ будете поставлять.

Онлайн активация - самое удобное что есть, если грамотно реализовать.

Анна, судя по вашим вопросам, учат вас по жутко древним и устаревшим материалам. Поэтому если вам нужно подготовиться именно к экзамену - насилуйте вашего преподавателя, потому что нахватавшимь современных и актуальных представлениях о том, как это все работает - вы можете с вашим преподавателем не сойтись во мнениях.
А во-вторых 30 лет назад, во времена Нортона, все это было в разы проще чем сейчас, поэтому как бы давалось пользователям. Сейчас это все усложнилось настолько, что не каждый администратор углубляется в подобные вопросы.
То же управление процессами в Линуксе - сменилось уже несколько представлений о том, как это должно работать. Многие современные курсы все еще оперируют timeslice, хотя они уже давно устарели. Многие считают что CFS это стандарт, а он лишь треть того, что происходит на самом деле.

Изучение архитектуры на "глубоком уровне" займет всю жизнь.
Поэтому учите и архитектуру и ОС одновременно, понемногу понимая что и как.

Есть книга - начните. Неужели прочитать книгу это так долго? Меньше тратьте время на задавание вопросов не по существу, больше - на чтение.

Сперва было неплохо бы научиться писать просто программы, а затем уже целую операционную систему.
Или вы думаете, что ядро это самое простое, что есть в операционной системе?