Разобрался! Отвечу сам на свой вопрос, может кому понадобится.
Чтобы установить событие на свои кнопки в своей кастомной Big Notification. Следует использовать такую конструкцию.
Intent tt = new Intent(this, SettingsActivity.class);
TaskStackBuilder ss = TaskStackBuilder.create(this);
stackBuilder.addParentStack(MainActivity.class);
stackBuilder.addNextIntent(tt);
PendingIntent rr = stackBuilder.getPendingIntent(
0, PendingIntent.FLAG_UPDATE_CURRENT);
expandedView.setOnClickPendingIntent(R.id.notif_btn_settings, rr);
//notif_btn_settings - ид Кнопки, expandedView это мой RemoteViews
Обязательно стоит использовать TaskStackBuilder иначе активити будет открыватся, но шторка не закроется сама!
Так же
не нужен класс ресивер MyButtonListener, флаг FLAG_ACTIVITY_NEW_TASK и прочее...