Виктор

1. Win7 - это первая Винда, которая уже умела понимать GPT. Собственно, этот стиль тогда и возник.
2. GPT и MBR - это стили разметки диска, и касаются они всего диска целиком. Нельзя сделать на общем диске один раздел GPT, а другой - MBR.
3. Продвинутые менеджеры разделов умеют конвертировать MBR в GPT и обратно без потери данных. Я для этого использую парагоновский HDM или Aomei Partition Assistant. Чтобы ими воспользоваться, не надо их устанавливать на комп и тем более покупать. Достаточно запуститься с любого из популярных ремонтно-восстановительных LiveDVD или LiveUSB - как правило, этот софт там есть.
4. Win10 вообще-то штатно ставится на GPT-раздел, но с помощью некоторых танцев с бубном можно принудить её разместиться на MBR, и она там нормально себя чувствует. Лично я опробовал для этого два способа. В любом из них надо, чтобы комп умел избавляться от UEFI и переходить на режим загрузки legacy (т.е. возвращаться к MBR). Сейчас всё больше производится компов, которые этого не умеют, в них вообще нет опции перехода в legacy.

Поскольку MBR у каждого диска свой, то всё касаемое его свойств относится только к данному диску. Если хотите нарастить ёмкость дискового хранилища сверх этого ограничения, то ставьте столько дисков, сколько на вашем компе есть подключений - проблем быть не должно.
Впрочем... если вы захотите объединить эти диски в RAID... Но в RAID я не силён, и как там скажется MBRовское ограничение, точно не знаю.

В формулировке вопроса не всё понятно.

я докупил себе HDD (подключён к SATA 1, при установке Windows 7 на него почему-то пришлось конвертировать его в GPT)

Во-первых, я так понял, вы решили установить ещё одну, вторую, Win7? Зачем???
Во-вторых, зачем размечать HDD в GPT? В те времена, когда Win7 была актуальной, GPT ещё не существовало, так что проблемам при установке неоткуда взяться.
Теперь о том, как бы я сам для себя решал подобную задачу.
1. Все диски размечаю в MBR (GPT я не люблю, хотя возможно, я просто не умею его готовить. Четырёх MBRовских разделов на диск мне всегда бывало достаточно).
2. HDD разбиваю на 2 раздела - для резерва ОС и для пользовательских данных.
3. Никаких вторых резервных ОС! Для этого достаточно сделать резервную копию первой ОС, которая находится на SSD (естественно, после того, как она наполнена пользовательским софтом, настроена и проверена). Этот бэкап можно просто разместить на HDD (тогда перед употреблением его придётся распаковывать на системный диск), а можно устроить т.н. "горячий резерв" - склонировать "один-в-один" системный SSD-раздел на HDD-раздел, предназначенный для ОС, после чего сделать его неактивным (т.е. незагрузочным, с помощью любого менеджера разделов) и скрытым (с помощью опции "Управление дисками" в ОС), тогда он не будет виден и не будет мешать загрузке. В случае такого "горячего резерва" перейти на него можно снятием скрытия и установкой флага "активный" (с SSD при этом надо поступить наоборот). Всё это занимает несколько минут, после чего комп стартует уже с HDD.

Мне показалось, что вы упомянули "форматирование" в смысле "уничтожение данных", а не в смысле "разметка файловой системы диска". Если это так, то довожу до вашего сведения, что продвинутые менеджеры разделов умеют конвертировать GPT-> MBR и обратно, не теряя данные (во всяком случае парагоновский и AOMEI умеют это точно - сам проверял, и не раз).
Где их взять? Вовсе не обязательно покупать и устанавливать их в свою ОС ради одноразовой нужды. Достаточно, скачав образ, создать какой-нибудь инструментально-восстановительный LiveDVD/LiveUSB, содержащий популярный набор утилит 2k10 (в нём есть эти менеджеры разделов и ещё много-много чего) - эта штука вам потом пригодится стопицот раз по самым разным поводам, не только по вашей нынешней проблеме.
Если затрудняетесь в выборе, порекомендую MultiBoot - сам им пользуюсь.