Всю диагностику надо проводить в момент возникновения проблемы. Если ее можно вызвать искусственно( т.е. например торможение обязательно проявиться на одном из 10 файлов ), то уже пол дела можно сказать сделано.
Как только проблема возникла.
1) Проверяем нагрузку на портах
2) Пытаемся создать доп.нагрузку, смотрим удалось ли( можно включить 4к виде на youtube с другого компа в том же vlan )
3) Пытаемся создать нагрузку из другого vlan.
4) Если утилизация канала с ростом нагрузки растет, нагрузка успешно "масштабируется", то пытаемся скачать файл аналогичного формата с другого сервера( в момент наличия проблемы ) в том же vlan.( формат файла может влиять на работу антивирусов )
5) Повторяем пункт 4 на компе, на котором есть проблема( есть прямо сейчас ).
Если все 5 пунктов показывают нормальную работу, значит проблема в канале между вами и сервером( в том числе проблема может быть с самим сервером ).
В любом случае это позволит вам отсечь кучу вариантов.