Для файлопомойки лучше 3,5 hdd, а им нужно питание 12v. Можно взять со старого бп.
Для подключения к sata портам есть удлинитель, папа-мама. В dvd можно через салазки подключить.
Но, учтите, со всеми прибамбасами и издержками проще комплект с xeon взять. Файлопомока, на Ubuntu к примеру, может и без видео крутится. Если нужна винда, можно там же виртуалку поднять.