А у вас конфиг точно отличается от дефолтного? Вы его тюнили, вносили правки? Или просто поставил mysql и пусть работает?
Судя по тому, что вы показываете - у вас дефолтный конфиг. Вы его показали. Что еще вы ищете?
ps xa - посмотрите, как запущен mysql, параметры там обычно видно и можно увидеть, какой конфиг он использует
